Karena seringnya petualangan seru dengan hal-hal supernatural dan kehidupan sekolahnya yang sibuk, Nene Yashiro hampir tidak bisa beristirahat sampai acara menginap tahunan Akademi Kamome tiba. Nene sangat bersemangat untuk bersenang-senang dengan sahabatnya, Aoi Akane, dan teman-teman sekelasnya di acara tersebut. Tanpa sepengetahuannya, acara menginap itu jatuh pada tanggal yang sama dengan Urabon, ketika garis antara orang mati dan orang hidup menjadi kabur, memungkinkan roh-roh jahat untuk keluar ke permukaan.
Ketika hantu jahat hendak menyerangnya, Nene diselamatkan oleh sosok misterius: Shinigami, Misteri Keenam yang dapat menjebak jiwa menggunakan sulingnya. Pada saat itu, Shinigami memperhatikan Aoi dan menculiknya untuk menggunakannya sebagai tumbal yang akan menutup penghalang untuk selamanya. Bergabung dengan Hanako-kun dan Akane Aoi, Nene harus memulai perjalanan ke batas terdalam dunia orang mati untuk menyelamatkan sahabatnya sebelum terlambat.
